唐僖宗中和三年（八八三年），曹洞宗二祖道膺禅师来主此山，僧众云集一千五百馀人，唐僖宗赐额「龙昌禅院」。道膺禅师（八三五～九〇二年），是佛教禅宗五宗之一曹洞宗洞山法系的传人。禅宗从初祖菩提达摩创建后，传到六祖惠能时分南宗惠能，北宗神秀，其后又分化为沩仰宗、临济宗、曹洞宗、云门宗、法眼宗五个派别。曹洞宗由良价（八〇七～八六九年）和本寂（八四〇～九〇一年）分别在江西洞山和曹山创立，主要是宣传理事不二、体用无碍的思想，「家风细密，言行相应，随机利物，就语接人」。而曹山这一法系四传后就断绝了，只靠洞山法系道膺禅师一脉在云居山真如寺弘法，使之得以绵延流传下来。从这个意义上说，真如寺是曹洞宗的源地。禅宗五宗中，沩仰、云门、法眼三宗在宋朝以后都失传了，只有临济和曹洞二家保存下来。由此也可看到云居山真如寺在佛教史上的地位。
道膺禅师住持龙昌禅院三十年，圆寂后 弘觉禅师。在五代至宋这段时间里，先后有道简、道昌、怀岳、怀满、德缘、智深住持，仍提倡曹洞宗。北宋大中祥符年间（一〇〇八～一〇一六年)，宋真宗敕改名为「真如禅寺」，一直沿习至今。
真如寺现塔林有建筑面积约一万平方米，主体建筑为天王殿、大雄宝殿、法堂、玉佛殿、禅堂、虚云老和尚纪念堂、寮房等，多为砖木结构的宫殿式重庑双檐大开间，上盖生铁铸瓦。寺属水田一百馀亩、山林三千三百馀亩。寺中尚存千年古银杏十馀株，其中有唐朝道膺禅师手植者，直径达二米，拔地参天，蓊郁苍翠。寺内还保留著南宋至明代的出土文物，清康熙年间铸造的千僧大铁锅等。寺庙周围有历代僧塔二十馀座，寺前还保留著佛印与苏东坡的谈心石以及赵州关、明月湖等字样石刻多处。
出寺门，梯田节节，山坡绿草如茵、灌木成林，沿坡上有溪水环流，水色清碧，终年不涸，名为碧溪。佛印桥飞架碧溪，苏东坡曾为之写下诗句：「欲与白论心事，碧溪桥下水潺潺。」听畔有巨石，莹洁平整，石下流水淙淙，石旁古树浓阴，相传苏东坡与佛印和尚曾谈经论法於此，故名「谈心石」。
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