赣州市博物馆成立于1960年，1999年撤地设市，赣州地区博物馆与赣州市博物馆合并成立新的市级赣州市博物馆。2006年4月，成立赣州市文物管理局，与赣州市博物馆、赣南客家博物馆实行三块牌子一套人马，为赣州市文广新局下属副处级全额拨款事业单位。赣州市博物馆馆藏古代文物和自然标本两万余件，藏品中以古代瓷器、字画以及客家民俗文物见长。
赣州市博物馆自成立以来，馆址一直位于八境台、文庙、郁孤台等文物景点内。在市委、市政府的关怀下，2009年9月，赣州市博物馆于兴国路15号建成新馆对外开放。设有“客家摇篮—赣州历史与文化”和“永远的荣光—赣州人民革命史”两个基本陈列。
为促进赣州市博物馆达标升级、创建全国一流博物馆，经赣州市委、市政府批准，2013年4月赣州市自然博物馆并入赣州市博物馆，位于章江新区的在建工程提升改造为赣州市博物馆新馆。兴国路博物馆展厅重新布展为中央苏区振兴发展主题展览。
赣州市博物馆新馆位于章江新区城市中央公园西侧赣康路与长宁路交汇处，占地61亩，总建筑面积28500平方米，其中陈展面积10300平方米。2015年12月31日，对外开放试运行，客家摇篮赣州、赣州七里镇窑陶瓷、恐龙奇观、丰饶赣州、植物园和防震减灾科普馆等6个展厅向社会免费开放。
赣州市博物馆是宣传赣州的重要平台，为了扩大博物馆藏品的社会影响力，提高优秀传统文化的传播力，能让更多的人了解赣州文化，感知历史，欣赏馆藏的珍贵文物。
设有客家摇篮赣州、赣州七里镇窑、恐龙奇观、丰饶赣州、室内植物园和赣州市防震减灾科普馆六个基本陈列展览，主要陈列了赣州出土的石器、青铜器、铁器、陶瓷、碑文等文物，恐龙骨骼化石、蛋巢化石、岩石矿物、动植物等自然标本，运用场景模拟和先进的声光电技术，全方位展现了赣州市客家历史文化、风俗地理、自然景观。
客家摇篮赣州展厅，是赣州市博物馆的主展厅，分为客家源流和经济文化两大篇章。客家源流篇按照时间顺序，采用文物说话的形式，通过沙盘模型、创作半景画、主题雕塑等形式讲述了赣州如何孕育了客家文化。经济文化篇讲述了客家人的耕读劳作、通商科教、人文民俗等内容。将客家人历史与经济文化生动地呈现在大家面前。
七里镇窑展厅，位于赣州市博物馆三楼，赣州七里镇窑陶瓷，是江西古代五大名窑之一，全国重点文物保护单位。为您展示了当时较具特色的龙窑窑炉、青白釉仿铜器兽首鹰爪三足鼎炉与仿青铜器陶鸟纹炉等。
恐龙奇观展厅，位于赣州市博物馆一楼东侧。在五组恐龙骨架、大量种类的恐龙蛋、哺乳动物标本等场景中，直观地了解恐龙的起源、恐龙的繁殖以及恐龙大灭绝的过程。
赣州市防震减灾科普展厅，位于赣州市博物馆一楼西侧。在这里，人们可以通过触碰展品来感知地震发生后不同的因素对我们产生的不同影响、在虚拟仿真场景中进行逃生训练等，了解地震相关知识、抗震房屋结构、赣州市发生地震时应急避难场所等内容，达到以科技体验地震，以知识保护生命的目的。
室内植物园，位于赣州市博物馆一楼西侧。展厅温度常年控制在26摄氏度左右，分为热带雨林展区和沙漠植物两个展区。人们通过一条半空的栈道，身临其境般感受到雨林和沙漠中两种截然不同的生态景观。
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