吐鲁番博物馆创始于1956年，随着我国博物馆事业的发展，三易其址才形成现今之规模，成为集典藏、陈列、征集和研究人类文化遗产实物的国家二级博物馆。吐鲁番自古以来就是古代欧亚陆路交通要冲，是丝绸之路重镇，东西方经济荟萃处，世界四大文明的交汇点。由于这里的气候干燥，雨量稀少，使残存在地上地下的古代遗迹和遗物能够较好地保留下来，成为华夏灿烂文明的活化石，西域丝路精妙绝伦的博物馆。早在石器时代，这里就有人类足迹。距今3000年左右进入青铜时代，于公元前60年，统辖于汉朝政权，正式列入中国版图。公元327年高昌建郡，460年后高昌王国建立，直至640年唐朝政权统一，又置西州管辖。840年以后，回鹘人建立政权。这里自古是多民族聚居区，多种宗教并行。车师、塞、匈奴、汉、羌、氐、回鹘等族，还有中亚来的粟特、安、石、米等昭武九姓人民友好相处，团结合作，用自己的劳动和智慧创造了这里的文明，为维护祖国统一和经济文化繁荣做出卓越贡献。整个展览以时间为线索，从刀耕火种的远古到经济繁荣的西州再到清代的吐鲁番郡王，共分为7个单元8个部分，在900多平方米的展厅里向观众展示了吐鲁番灿烂悠久的文化积淀。
吐鲁番博物馆共有9个展厅，开放基本陈列展厅5个。分别为吐鲁番通史陈列、巨犀化石陈列、出土文书陈列、古钱币陈列、出土千年干尸及其随葬遗物陈列。
共由7个文化单元8个部分组成，首先是丝绸之路和吐鲁番主要文物保护示意图，其他部份根据历史时期共分为7个单元，分别是：第一单 ——早期人类的活动；第二单元——姑师文化的发现；第三单元——西域都护府统辖下的车师；第四单元——高昌郡及麴氏高昌国；第五单元 ——唐西州经济文化的繁荣；第六单元——回鹘文化的发展；第七单元——清代的吐鲁番郡王。吐鲁番位于新疆东部，天山山脉南麓，扼古代欧亚路交通要冲，是丝绸之路重镇，东西方经济荟萃处，世界四大文明的交汇点。由于这里的气候干燥，雨量稀少，使残存在地上地下的古代遗迹和遗物能够较好的保留下来，成为华夏灿烂文明的活化石，西域丝路精妙绝伦的“博物馆”。早在石器时代，这里就有人类足迹。距今3000年左右进入青铜时代。于公元前60年，统辖于汉朝政权，正式列入中国版图。公元327年高昌建郡，公元460年高昌王国建立，直至公元640年唐朝政权统一，又置西州管辖。公元840年以后回鹘人建立政权。公元1884年清朝新疆建省。这里自古是多民族聚居区，多种宗教并行。车师、塞、匈奴、汉、羌、氏、回鹘等族，还有中亚来的粟特、安、石、米等昭武九姓人民友好相处，团结合作用自己的劳动和智慧创造了这里的文明，为维护祖国统一和经济文化繁荣做出贡献。通史陈列厅主要展出吐鲁番地区自建国以来考古出土、征集、采集、捐赠的文物精品。整个展览以时间为线索，从刀耕火种的远古到经济繁荣的唐西州再到清代的吐鲁番郡王，向观众展示吐鲁番灿烂悠久的文化积淀。
展示的是吐鲁番的自然历史。巨犀化石陈列厅共分四部分，分别为古动物展区、巨犀化石展区、生命的起源展区以及灵长类的起源展区。展厅运用了声光电等现代展示技术，通过实物、图片、场景、模型、多媒体查询、幻影成像等多种展示手段，强调拉近博物馆与观众的距离，增加观众参观的兴趣。这里展出的巨犀化石是1993年兰新铁路复线修筑过程中在吐鲁番东部的飞跃火车站发现的，是陆地上曾经生存过的最大的哺乳动物，它生活在距今2400万年前的渐新世，体长约9米，体高约5米，体重约30吨，每天大约要吃500公斤的绿色食物。巨犀化石是吐鲁番博物馆的镇馆之宝。据考证，这是世界上出土最完整的一具巨犀骨架化石。
展示了吐鲁番洋海、交河沟西、阿斯塔那等墓地出土的一批古钱币精品以及由著名的钱币收藏家杜维善先生捐赠的35枚萨珊波斯金银币。
主要展示了吐鲁番出土文书。其中契约、籍帐、官府文书、私人信札等展品是研究魏晋南北朝以及隋唐史的重要资料，粟特文、回鹘文、梵文等古代文字文书是研究古代西域多元文化发展、交流融合的珍贵资料。
展出的出土干尸，数量众多、人种丰富。年代从商周时期至清代时期，主要出自阿斯塔那哈拉和卓古墓群和苏贝希古墓群、洋海古墓群等。由于吐鲁番特殊的气候条件和地理特征，使得这里成为世界上保存干尸数量最多、质量最好、时代最丰富的地区之一。除此之外，大量的人体骨骼标本也在这里的得到了完好的保存。
夏季（4月15日-10月15日）10:00-18:30
冬季（10月16日-次年4月14日）10:30-18:00
（周一闭馆，国庆节、春节、古尔邦节正常开馆）
乘坐101、202、208路公交车即可到达。
吐鲁番博物馆藏品类别有石器、陶器、泥塑、木器、铜器、铁器、金银器、文书、木雕、泥俑、绘画、古尸、粮食、干果及各类食品、泥塑、纺织品、干尸等35种。举世闻名的吐鲁番美丽巨犀化石、吐鲁番出土文书、吐鲁番出土毛纺织品、吐鲁番彩陶、吐鲁番干尸等都是馆内的镇馆之宝。
吐鲁番早期文化以彩陶和素陶为代表，具有明显的地域民族特征。吐鲁番博物馆馆藏丝织品种类很多，是丝绸之路重镇的典型文化遗存。装饰图也以西域常见的对鸟、骆驼、孔雀、马鹿、双鸭等连缀圆形为多，其中十六国时期的共命鸟纹刺绣和唐代的花鸟刺绣等，都是难得的稀世珍宝。
吐鲁番出土文书举世闻名。其中有官府文书、任命书、户籍、粮贴、药方、私人信札、佛教典籍、买卖契约、死者随葬衣物清单等等，涉及政治、经济、文化、宗教、民族、习俗等社会生活的各个方面，是了解和研究西域和吐鲁番古代社会的重要历史资料。这些文书的文字具有多样性，有粟特文、回鹘文、梵文、西夏文、蒙古文、汉文等24种之多。其中，柏孜克里克石窟出土的彩绘粟特文摩尼教经卷残片是稀世珍宝。
吐鲁番曾出土并收集到众多货币，除中国通用和吐鲁番当地使用的货币外，还有流行于丝绸之路上的中亚、西亚和欧洲等地的货币。这些都是丝绸之路文化交融、经济繁荣的重要实物见证。
吐鲁番博物馆展出的千年干尸，从春秋战国时期至清代时期，主要出自吐鲁番阿斯塔那哈拉和卓古墓群和苏贝希古墓群、洋海古墓群等。它是珍贵的标本，对人类学、考古学、医学等学科的研究，特别是对新疆历史的研究有着重要的科学价值。
吐鲁番博物馆展出的吐鲁番美丽巨犀化石，是1993年兰新铁路复线修筑过程中在吐鲁番东部的飞跃火车站发现的。吐鲁番美丽巨犀是地球上曾经生存过的最大的陆生哺乳动物，它生活在距今2400万年前的渐新世，体长约9米，体高约5米，活着的体重约30吨。巨犀化石陈列厅内的吐鲁番美丽巨犀化石是吐鲁番博物馆的镇馆之宝。据考证，这是世界上出土最完整的一具巨犀骨架化石。
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