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1.富士山
上榜理由：完美锥形火山，日本精神象征。
富士山横跨静冈与山梨两县，海拔3776米，是日本最高峰。其近乎完美的对称锥形山体由数十万年的火山喷发层层堆积而成，2013年以“信仰的对象与艺术的源泉”之名列入世界文化遗产。从河口湖、山中湖或新干线上眺望，富士山四季表情各异：春樱、夏绿、秋枫、冬雪。登顶通常在七至九月开放，其余季节可远眺或至五合目。
2.白神山地
上榜理由：世界最大山毛榉原始林，生态宝库。
白神山地位于本州北部秋田与青森交界处，1993年与屋久岛共同成为日本首批世界自然遗产。这里拥有世界最大规模的山毛榉原始林，未经人为干预，森林中栖息着黑熊、日本猴与多种珍稀鸟类。核心区域的青池湖水呈钴蓝色，枯木立于水中，四季景色各异。徒步路线从初学者到高级者均有覆盖，是感受原始森林力量的绝佳之地。
3.屋久岛
上榜理由：千年屋久杉与苔藓森林，生命秘境。
屋久岛位于鹿儿岛县南部，1993年列入世界自然遗产。岛上降雨极多，被称为“一个月下三十五天雨”的地方，湿润气候孕育了树龄超过千年的屋久杉。绳文杉树龄估计在2000至7000年之间，白谷云水峡的苔藓森林是宫崎骏《幽灵公主》的灵感来源。徒步路线从几小时到十小时不等，适合不同体力水平的旅行者。
4.知床半岛
上榜理由：流冰与野生动物，世界自然遗产。
知床半岛位于北海道东部，2005年列入世界自然遗产。冬季流冰从鄂霍次克海南下，覆盖半岛沿岸，是日本唯一能看到流冰的地方。半岛拥有棕熊、虾夷鹿、狐狸与多种海鸟，罗臼岳与硫磺山构成壮丽山景。流冰漫步与观鲸船是冬季特色体验，夏季则可徒步知床五湖，感受原始自然的完整生态。
5.小笠原群岛
上榜理由：独特生态系统，东洋的加拉帕戈斯。
小笠原群岛位于东京以南约1000公里，2011年列入世界自然遗产。因从未与大陆相连，岛上进化出大量特有物种，被称为“东洋的加拉帕戈斯”。父岛与母岛是主要有人岛，可观赏座头鲸、海豚与特有鸟类。从东京乘船约24小时可达，游客稀少，适合想彻底远离喧嚣、探索独特生态的旅行者。
6.藏王树冰
上榜理由：雪怪奇观，冬季限定。
藏王连峰位于山形与宫城交界处，冬季强烈的西风将水汽冻结在针叶树上，形成巨大的“树冰”，形如雪怪，夜间点灯后尤为梦幻。藏王缆车可直达树冰原，是日本最具视觉冲击力的冬季自然奇观之一。藏王温泉的千年硫磺泉与树冰观光可组合成完整的冬季体验。
7.立山黑部雪墙
上榜理由：二十米雪谷，春季震撼。
立山黑部阿尔卑斯路线横跨富山与长野，每年春季开山时，室堂附近的道路两侧积雪被铲出高达二十米的雪墙，形成壮观的雪谷走廊。游客可步行其间，感受雪墙的压迫感。夏季雪墙逐渐融化，取而代之的是高山植物与御库里池的碧蓝湖水。这条路线本身也是日本最具代表性的山岳观光线路之一。
8.高千穗峡
上榜理由：火山峡谷与真名井瀑布。
高千穗峡位于宫崎县北部，是阿苏火山喷发后岩浆冷却形成的柱状节理峡谷。峡谷长约七公里，两岸悬崖高耸，真名井瀑布从十七米高处落入碧绿溪流。可乘小船穿行峡谷，仰望瀑布与柱状岩壁。高千穗也是日本神话中天照大神之孙降临之地，自然与传说在此交织。
9.秋吉台
上榜理由：日本最大喀斯特台地，石灰岩奇景。
秋吉台位于山口县中部，是日本最大的喀斯特台地，面积约130平方公里。台地上散布着无数石灰岩柱与凹地，地下则有秋芳洞等大型钟乳石洞窟。秋季草原被染成金色，冬季则覆盖薄雪。秋吉台的石灰岩地貌形成于约三亿年前，是日本地质史上最珍贵的自然遗产之一。
10.鸟取沙丘
上榜理由：日本唯一大型沙丘，沙漠与海。
鸟取沙丘位于鸟取县东部，是日本唯一的大型沙丘，东西长约十六公里。沙丘与日本海相接，形成沙与海同框的独特景观。可骑骆驼、滑沙或乘缆车观看沙丘全景。沙丘的纹理与光影随天气与时间变化，是日本最具异域感的自然奇观之一。
