HPA人类蛋白质图谱

基本介绍

2003年完成的人类基因组计划成功地对所有20,000个蛋白质编码基因（蛋白质组）进行了测序，这是一项巨大的科学成就，但这实际上只是一个开始。下一步是检查蛋白质组以开始了解所有这些蛋白质的功能。

人类蛋白质图谱(HPA)项目于2003年启动，目标是使用基于抗体的蛋白质组学系统地绘制这些蛋白质的表达。该计划主要设在瑞典，由非营利组织Knut和Alice Wallenberg基金会(KAW)资助。内部生产和商业购买的抗体首先由研究人员验证，然后用于表征每种蛋白质。

数据可通过开放式交互式数据库获取：www.proteinatlas.org.

它包含数百万张高分辨率图像，显示44种不同正常人体组织(Tissue Atlas)和20种不同癌症类型(Cancer Atlas)中76 种不同细胞类型的蛋白质表达的空间定位。

在美国细胞生物学学会（ASCB，2016年12月）上，一个新的Cell Atlas在HPA的更新版本（第16版）中发布，参加人数众多。

特色功能

它的特点：

l 免疫荧光染色细胞的高分辨率、多色图像

l 代表人体不同器官细胞群的56种细胞系中蛋白质的亚细胞空间定位

l 使用深度RNA测序表征的所有人类基因的mRNA表达

l > 12,000个基因和可用抗体映射到30种不同的细胞结构（即细胞核、胞质溶胶、线粒体等）

精确定位蛋白质的亚细胞定位对于理解其功能至关重要。当它们定位到预期的微环境（即细胞器、囊泡或大分子复合物）时，它们将在合适的生化条件下遇到其他蛋白质或RNA以实现其分子功能（Breckles，2016）。这份全面的图谱为世界各地的研究人员对蛋白质功能进行更复杂的研究提供了急需的工具。

以下是Cell Atlas中的一些示例图像：

CCNB1：细胞周期蛋白B1是一种调节蛋白，位于细胞质中，参与人和小鼠细胞的有丝分裂。它主要在细胞周期的G2/M 期以细胞周期依赖性的方式表达。在图中，U-2 OS人细胞系中的细胞周期蛋白B1蛋白表达（抗体HPA030741）以绿色显示，而细胞核为蓝色，微管为红色。

蛋白质图谱

DAXX：死亡域相关蛋白6是一种多功能蛋白，主要定位于人和小鼠细胞的细胞核和核体，但也在细胞质中表达。DAXX 与有丝分裂G2期的着丝粒相关。在细胞质中，它通过与细胞凋亡抗原Fas相互作用来调节细胞凋亡。该图显示了细胞系A-431中细胞核内的核体（GFP标记的抗体HPA008797）中的表达。