佑安寺摹仿北京金銮殿、雍和宫和青海等地名寺式样建造。它是集汉、蒙、藏三个民族建筑风格于一身的殿阁群。面积广大，建筑宏伟、布局对称合理，是一所规模较大的喇嘛庙，佑安寺为绥东第一大庙。
佑安寺占地300余亩，建筑占地200余亩。它坐北朝南，整个建筑呈长方形。以居中三层正殿为轴心，东西两侧对称式布局。主体建筑为三层楼正殿，居中央，两侧配殿为二层楼，一为文殊殿，一为普意殿，其余对称排列各种神殿佛堂，还有僧舍和伙房、仓库等。从南到北五进院落、三层殿阁。从东到西，各有侧殿配房几十间。庙内曲径回廊，庭台楼阁，红砖灰瓦，错落有致，抱粗榆树荫盖，森严中有几分幽静。僧舍建在大殿的两个街巷，各为独立藏式院落。
庙宇东西有两股清泉，从山涧流出，东有石拱桥一座（当地称大水道），中央正门（山门）为红砖二层阁楼，门前有石狮一对，七米高木质玛尼杆（经幡杆）两根，后有钟楼古楼相配，还有藏经阁对峙而筑。正对四大天王庙，绕过四大天王庙，踏二十七级石阶则步入正殿。
正殿（当地称“三级楼”）规模最为宏伟，雕梁画栋，金碧辉煌。主体建筑宫殿楼阁折合房屋669间。天井内四根 巨木高柱直抵极顶，直径约为二尺（全为同样粗树木用卯相接，后缠麻丝，用牛皮纸包裹，红色桐油漆刷其表皮）其柱看似四根直径相同，上下同粗的擎天大柱。其余四十多根小柱分散支撑在殿宇内厅四周，宽敞明亮，建筑设计科学合理。殿内正中大佛底座共分大小不等佛像排列，还有供奉的铜盅、银碗，四周墙壁彩画连幅，经幡幌伞笼罩，宫灯彩帘悬挂，鼓钹法器陈列，铺展两排地毯。佛大僧小，庄严肃穆。诵经等大小佛事皆在此殿举行。正殿二层前檐正中有风磨铜铸成黄铜鹿和法轮（喇嘛教象征），金光闪烁，几里之外遥遥可见。
整个庙宇乃为官办，因此分为东西两仓，东仓为三丈六尺高佛殿。内塑释迦牟尼铜像，硕大无比，怀中能坐8人。
佑安寺内有三种东西远近闻名，有口皆赞。人们俗称“三大”。即大佛、大锅、大水道。
大佛，即三丈六尺高的铜佛爷，即释迦牟尼铜塑像，它安放在东仓二层高楼。据说用铜5000余斤，察哈尔多伦铸成并马车运来，拼装而成，表层镀金，整座佛像金光闪闪，高大形象令人仰而观止，逼真的铸造技艺堪为一流水平。
大锅，是佑安寺僧用膳房中一口铸铁锅，供万名朝圣敬香者喝奶茶。每到大型佛事活动，提前一个月用羊砖（干羊粪砖）烧茶，然后才够饮用。此锅盛水约万余斤，洗锅有专用梯，无专用梯人难爬上。而且所铸之锅技艺精湛，外边锅沿铸有花边云纹，还有铸造时间地点，天下无双。此膳房占地近三百平米，而且还配有中锅两口。此锅烧完粪灰堆积如山，在佑安寺西南角遗迹尚存。
大水道（石拱桥），即佑安寺为防止东北角顺山势而下洪水，修建的一座石拱桥，其桥为白色长方形石条而砌。桥孔内可并排行走车五辆，藏人上千，其桥跨度大而坚实，造型奇特美观。石拱桥石条后在1958年修黄石崖水库用于铺砌库岸和闸门过水道。
佑安寺始建于明朝万历年间，康熙三十年前后扩建和修葺，雍正十年完工。佑安寺直接属北京雍和宫管辖，常有喇嘛进京进修学习，而且雍和宫下派喇嘛数十人，当地人称为“北京喇嘛”。另外和青海、西藏等名寺大庙有交流经历，当地有几十峰骆驼驮银百两去拉萨交换经卷的佳话。
康熙四十三年(1704年)，在土默特右旗王府(黑城子)东10公里处，清廷拨款修建“佑安寺”，俗称巧尔基庙。该寺建殿堂l0座，共84间。有法相僧院、时轮僧院、医药僧院。香火盛期有喇嘛500多人。寺院有耕地6000亩、牲畜1300头、车辆3台。寺主为呼图克图。
康熙二十一年（ 1682 年）康熙东巡，经喜峰口、热河、凌源、朝阳、北票黑城子“驻跸于喇嘛寺”。
康熙二十八年，建成“佛殿、天王殿、东西配殿，佑安寺碑文记之：“满堂圣像，顶礼之，大金灯常点照，玉炉焚香”。此后，于喇嘛去北京觐见皇帝，康熙亲赐汉白玉二龙戏珠碑冠，以及银孥若干，继续扩修寺庙。康熙四十三年（ 1704 年）山门殿、大经殿、八狮托底塔等相继建成，主题工程竣工。康熙亲书佑安寺名，赐蓝地金字雕龙匾一块。册封于喇嘛为佑安寺一世活佛，并授予段文牍（委任状）、印章、瓷碗、瓷盘以及查玛舞面具和袈裟等。
在兴和县城关镇西北约22公里处，有一处颇具名气的藏传佛教胜地－－佑安寺，俗名巧尔基庙（召）。“巧尔基”乃喇嘛教最高学位，系乾隆年代所赐学位。有此学位特许直接晋见皇帝，遇有大事可径直去向皇帝面奏，而且免行跪拜礼。佑安寺主持活佛享有此特权，足见其当年这座庙宇之威望及影响。
解放后，列为内蒙古自治区文物保护重点单位，地方政府供养喇嘛10人，佛事活动费用计划供给。有喇嘛三宝、达木沁、达嘎斯楞、刚格、沙木腾、阿要海、龙利格、刚木吉等掌管打扫庙宇，举行小型佛事活动。
佑安寺在“文化大革命”中遭到毁灭性破坏，遗迹尚存。
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