萧芳芳原名萧亮，1947年3月13日出生于上海，祖籍江苏省苏州市吴县甪直，父亲萧乃震，曾经留学德国，母亲成丰慧，工于绘画。萧芳芳2岁时便随同父母移居香港，但在3岁时父亲便离开了人世，留下她和母亲相依为命。
幼年即从影的萧芳芳因为无暇接受正规教育，母亲聘请了数位家庭教师为她补习文化课和学习英语。母亲还让她跟随粉菊花、王仁曼、傅雷分别学习京剧、芭蕾舞、书法。她还学会了绘画、骑马、射箭、舞剑、功夫。
1953年，6岁的萧芳芳在舞台剧《家》中反串演出孙少爷高海臣。
1954年，萧芳芳7岁生日刚过，萧母的朋友导演李化邀请萧芳芳在其新戏《小星泪》中客串一角，萧芳芳至此正式涉足影坛。萧母也因此发现了女儿在演艺方面的天赋，此后便开始着力培养萧芳芳的演艺能力。第二年萧芳芳便考入了香港中联影业公司，与少年李小龙一同演出了电影《孤星血泪》。
1955年，萧芳芳与林黛合作主演了《梅姑》。萧芳芳饰演女主角的童年。此片为萧芳芳成名作，刚出道两年的她就凭借该片赢得了第二届东南亚影展最佳童星奖。艺名“芳芳”也是该片导演严俊为她所取 。
1958年，令萧芳芳成名是她11岁时与息影30年复出的胡蝶合作主演的电影《苦儿流浪记》，该片是第一部获旧金山国际影展金奖提名的中国电影。该片由萧芳芳演唱的主题歌《世上只有妈妈好》日后还被引入台湾电影，成为三地广为流传的歌曲。
1960年，13岁的萧芳芳出演了第一部武侠片《青城十九侠》和第一部粤语片《芸娘》。此后，她走红粤语影坛，至1966年，短短的几年间萧芳芳总共出演了100多部古装片，有时一个月内她要两三部影片的拍摄任务 。
1966年，19岁的萧芳芳加盟光艺电影公司，出演她的第一部时装戏《少女心》，影片中她一人饰演三个角色，载歌载舞一共跳了18支舞。
此后萧芳芳又拍摄了一系列时装片，在《飞贼红玫瑰》中，她一人饰演10个角色。在《紫色风雨夜》中她表演了恰恰、爵士、古典芭蕾舞以及各种土风舞。在《飞女正传》中，萧芳芳塑造了一位叛逆少女的形象，创下了彼时香港粤语片的票房纪录。此时萧芳芳成功从一个古装片演员转型为时装歌舞片演员。
20世纪六七十年代，香港艺人流行结拜，萧芳芳、冯素波、沈芝华、陈宝珠、薛家燕、王爱明及冯宝宝7个女孩，因为同为童星和演粤语片出身而相识并结拜组成了“七公主”，萧芳芳被称为“玫瑰公主”。 “七公主”还合作拍摄过一部同名电影《七公主》。
1970年，萧芳芳弃影前往美国留学。1973年，萧芳芳取得了大众传播学学士学位后回到香港。她原本打算接母亲在美国定居并继续攻读学业，但最终被台湾导演说服去日本与秦祥林合作拍摄了《广岛廿八》。
1974年，重返影坛的萧芳芳开始尝试不同类型的片种与角色。，与秦祥林、林青霞联袂主演了《女朋友》，萧芳芳凭借此片获得了第12届台湾电影金马奖最佳女配角奖。同年，主演的《海韵》她赢得了第5届西班牙影展最佳女主角奖。
1975年，她再度与秦祥林合作主演《西贡.台北.高雄》。
1976年，肖芳芳自编、自导、自演了影片《跳灰》。被香港影坛评价为香港电影新浪潮的前奏之作。
1977年，她在香港无线电视台主持搞笑节目《点只咁简单》，塑造了“林亚珍”这一傻大姐形象， 随后萧芳芳自组电影公司将这个人物搬上大银幕，监制并演出了一系列的“林亚珍”电影。
1979年，与导演许鞍华合作，自制、自演《撞到正》（又名《小姐撞到鬼》），淡化肢体语言，融入民俗元素。
1980年，去台湾主演电视剧集《秋水长天》，凭借该剧集萧芳芳获得了第16届台湾电视金钟奖最佳女主角奖。
1982年，萧芳芳再次去美国深造 。1984年回到香港。
1988年，主演喜剧片《不是冤家不聚头》，同年萧芳芳凭借此片获得第7届香港电影金像奖最佳女主角奖。
1993年，与李连杰合作演出《方世玉》，饰演方世玉母亲苗翠花，电影中苗翠花武功高强、好抱不平，但却粗心鲁莽。凭借此片中的表现使她开始为内地影迷所熟知。同年她与许冠文合演贺岁片《抢钱夫妻》，两部影片同时入围当年香港金像奖最佳女主角奖。
1995年，萧芳芳在电影《女人，四十》中饰演一位饱受生活困扰的中年女性，凭借该片获得第15届香港电影金像奖、第1届香港电影金紫荆奖、第2届香港电影评论学会及第32届台湾电影金马奖最佳女主角奖，并获得了第45届柏林国际电影节最佳女主角奖，成为继张曼玉之后中国第二位柏林影后。同年，获得亚洲电影人协会最高成就奖。
1996在，电影《虎度门》中饰演一位粤剧名伶，凭借此片，萧芳芳荣获第41届亚太电影节及第33届台湾电影金马奖最佳女主角奖。
1997年，因为多年来演出成就，萧芳芳获颁英女皇MBE勋衔及香港艺术家年奖。
1997年，她与柯受良、赵文卓合作主演《麻雀飞龙》后，萧芳芳因受耳患困扰，基本在银幕上绝迹。该片也成了萧芳芳的最后一部影视作品。
1999年，萧芳芳凭借“林亚珍”这一经典角色被TVB评选为“我最难忘的5位女主角”之一。
2009年，已接近失聪的萧芳芳获得第28届香港电影金像奖颁奖典礼终身成就奖，以表扬其在香港电影界作出的贡献。
麻雀飞龙1997 饰演范秀钿 导演元奎、刘镇伟、黎大炜 主演赵文卓、柯受良、卢惠光、林寄韵、国建勇、吴君如、曾近荣
虎度门1996 饰演冷剑心 导演舒琪 主演袁咏仪、锺景辉、谭倩红、陈晓东、李司棋、李子雄
女人四十1995 饰演阿娥 导演许鞍华 主演罗家英、乔宏、罗冠兰、夏萍、丁子峻、谭倩红
抢钱夫妻1993 饰演蒋太 导演张之亮 主演许冠文、陈少霞、左诗蓓、邓一君、雷宇扬、刘玉翠
陈健没有杰克电影院（短片）1993 导演关锦鹏 主演张曼玉
方世玉1993 饰演苗翠花 导演元奎 主演李连杰、李嘉欣、胡慧中、陈松勇、朱江、赵文卓、陈龙、郑少秋
方世玉续集1993 饰演苗翠花 导演元奎 主演李连杰、李嘉欣、郭蔼明、郑少秋、元奎、计春华、陈龙
漫画威龙1992 饰演牛牡丹 导演左颂升 主演周星驰、钟镇涛、陈伯祥、张敏、元华、胡枫、元奎、尹扬明
两个女人，一个靓一个唔靓（短片）1992 导演关锦鹏 主演张曼玉
新精武门19911991 饰演牛牡丹 导演罗维、左颂升 主演周星驰、钟镇涛、陈伯祥、张敏、胡枫、元奎、尹扬明、成奎安
不是冤家不聚头1987 饰演黄梅 导演姜大卫 主演吴耀汉、秦沛、陈国新、李琳琳、关佩琳、焦姣、湘绮、谷峰
奸人鬼1984 饰演美琪 导演陈家乐 主演狄龙、陈百祥、石坚、曹达华、梁俊杰
佳人有约1982 饰演萧珠珠 导演陈勋奇 主演陈勋奇、廖伟雄、郑则仕、陈秀珠、刘克宣、吴浣仪、李修贤
八彩林亚珍1982 饰演林亚珍 导演吴宇森 主演许冠英、罗文、李琳琳、陈星、胡枫、刘克宣、胡大为
撞到正1980 饰演阿芝 导演许鞍华 主演钟镇涛、关聪、刘克宣、刘天兰、蒋金
林亚珍老虎鱼虾蟹1979 饰演林亚珍 导演黄华麒 主演伊雷、胡大为、汪伟、戴志伟、叶德娴、吴浣仪
海韵1976 饰演宋丹妮 导演李行 主演胡燕妮、柯俊雄、秦汉、崔福生、王宇、凌玲
跳灰1976 饰演佩珊 导演萧芳芳 / 梁普智 主演嘉伦、陈星、陈惠敏、胡枫、李燕萍、卢海鹏
未了缘1976 饰演张安娜 导演曾江 主演曾江、凌云、胡燕妮、唐菁、王莱
西贡.台北.高雄1975 导演林福地 主演秦祥林、李虹、李伟、张冰玉、韩甦
女朋友1974 饰演孟雅蘋 导演白景瑞 主演秦祥林、石峯、林青霞、于荣、江彬、江明、夏台瑄
广岛廿八1974 饰演今井芳子 导演龙刚 主演秦祥林、焦姣、关山、李琳琳、金川、龙刚、唐菁
李小龙的生与死（纪录片）1973 导演吴石 主演王玫、李小龙、琳达、李国豪、 李香凝
独掌震龙门1970 饰演方碧儿 导演吴回 主演曾江、冯宝宝、关海山、任燕、黄鹤声、林蛟
合欢歌舞庆华年1969 饰演李婉芬 导演莫康时 主演冯宝宝、邓光荣、俞明、郑君绵、蓝天、谭炳文、罗兰、伊雷
王老五的日记1969 饰演客串 主演康威、沈殿霞
雌雄妙贼1969 饰演王婉萍 导演陆邦 主演曾江、沈殿霞、郑君绵、俞明、容玉意
香喷喷小姐1969 饰演戴安娜 导演陆邦 主演何藩、薛家燕、张清、郑君绵、伊雷
峨嵋霸刀1969 饰演罗凤英 导演陈烈品 主演曾江、石坚、沈芝华、吴殷志周吉、容玉意、柠檬、杨业宏
多情高窦猫1969 饰演杨玉凤 导演莫康时 主演胡枫、夏萍、张仪、麦基
飞女正传1969 饰演徐玉贞 导演龙刚 主演龙刚、夏萍、曾江、薛家燕、沈殿霞、伊雷、王爱明
四凤求凰1969 饰演胡月华 导演何建业 主演吕奇、李司棋、冯宝宝、梁醒波
玫瑰芍药海棠红1969 饰演洪玫瑰 导演黄尧 主演吕奇、薛家燕、汪明荃、钟叮当、石修
花月争辉1969 饰演李多利士 导演黄尧 主演吕奇、薛家燕、沈殿霞、戴伟光、司马华龙、高鲁泉
龙飞凤舞1969 饰演美凤 导演黄尧 主演吕奇、薛家燕、沈殿霞、戴伟光、司马华龙、高鲁泉
萧芳芳告别影坛数十红星联欢会特辑（新闻纪录片）1969
妈妈要我嫁1969 饰演洪丽云 导演陆邦 主演薛家燕、曾江、张清、俞明、高鲁泉
横冲直撞入情关1968 饰演张美丽 导演蒋伟光 主演胡枫、丁慧、俞明、沈殿霞、郑君绵、区燕青
欢乐满人间1968 饰演林芳华 导演蒋伟光 主演胡枫、郑文芳、李红、夏萍、郑少秋、高峰、容玉意
快乐年年1968 饰演杨莉莉, 梅芬 导演蒋伟光 主演胡枫、郑君绵、沈殿霞、俞明、西瓜刨、高鲁泉、骆恭、黎雯
铁血火龙令1968 饰演李玉环 导演张英 主演陈宝珠、石坚、于素秋、张英才
青春恋歌1968 饰演马丽娟 导演楚原 主演谢贤、周骢、陈齐颂、沈殿霞、俞明
五月的红唇1968 饰演林爱莲 导演黄尧 主演康威、白瑛、俞明、林静、黎雯、白明、唐迪、骆恭
紫色风雨夜1968 饰演张紫燕 导演楚原 主演谢贤、南红、曾江、孟莉、小麒麟、骆恭
大情人1968 饰演王丽娜/成美珍 导演蒋伟光 主演胡枫、林蛟、金雷、周吉、黎灼灼、白文彪
千面女福星1968 饰演杨绮华 导演陆邦 主演张仪、洪红、罗兰、麦基、司马华龙
窗外情1968 饰演杜洁芳 导演何建业 主演谢贤、黎婉玲、张瑛、王伟、李允中
贼千金1968 饰演潘芬妮 导演陈云 主演胡枫、俞明、孟莉、戴伟光、高明、王爱明
浪子佳人1968 饰演徐玉冰 导演陈云 主演谢贤、俞明、龙刚、伊雷、高峰
夺魄幽灵1968 饰演安娜 导演珠玑 主演曾江、夏萍、张英才、吴回、司马华龙、柠檬
观世音收群妖1968 饰演柳摇金 导演黄鹤声 主演关海山、阮兆辉、李红、萧仲坤、西瓜刨、于素秋、陈宝珠
窗1968 饰演陆露明 导演龙刚 主演谢贤、张仪、龙刚、曼莉
蓝鹰1968 饰演蓝鹰 导演王风 主演沈芝华、郑少秋、夏萍、石坚、麦基
冬恋1968 饰演黄咪咪 导演楚原 主演谢贤、王爱明、司马华龙、黎雯、徐小明
花样的年华1968 饰演戴安娜 导演黄尧 主演吕奇、薛家燕、沈殿霞、叶青、戴伟光
锁着的新娘1968 饰演柳青薇 导演陈云 主演曾江、姜中平、罗兰、梁漱华、王爱明、黎灼灼
少女情1967 饰演施洁芳 导演楚原 主演南红、唐晶、朱江、曾江、黎雯
金鸥1967 饰演金鸥 导演陈文 主演谢贤、余美华、李鹏飞、唐佳、刘家良
七公主（上集）1967 饰演陆秀琼 导演凌云 主演陈宝珠、薛家燕、王爱明、沈芝华、冯素波、冯宝宝、骆震宇
一步一惊心1967 饰演吕淑庄 导演魏海峰 主演胡枫、石坚、金雷、沈殿霞、郑君绵、司马华龙、关正良
玉女神偷1967 饰演王家玉 导演楚原 主演吕奇、梁醒波、李香琴、许英秀、良鸣、安伟琏
圣火雄风大破火莲阵1967 饰演杜娟儿 导演萧笙 主演陈宝珠、李红、吴千枫、罗兰、郑君绵、西瓜刨
神探智破美人计1967 饰演凤子 导演黄森 主演谢贤、周骢、高鲁泉、石坚、龙刚
金骷髅1967 饰演林珍妮 导演王风 主演张英才、高烽、关正良、金露张莱莱、李英
钻石大劫案1967 饰演马佩珊 导演楚原 主演谢贤、陈齐颂、李亨、李鹏飞、良鸣、万灵
红粉金刚1967 饰演郭小兰 导演杨权 主演胡枫、林韵、石坚、蓝天、方华
玉郎三戏女将军1967 饰演刘金定 导演萧笙 主演陈宝珠、靓次伯、李凤、玫瑰女、李龙
七公主（下集）1967 饰演陆秀琼 导演凌云 主演陈宝珠、薛家燕、王爱明、沈芝华、冯素波、冯宝宝、骆震宇
欢乐歌声处处闻1967 饰演龙丽珠 导演胡鹏 主演吕奇、蓝天、罗兰、俞明、金雷、骆恭、许莹英、夏莉萍
血染铁魔掌1967 饰演丁惠娟 导演卢雨岐 主演吕奇、雪妮、麦基、周吉、石坚
玉女亲情1967 饰演蔡婉华 导演莫康时 主演吕奇、张仪、贺兰、石坚、麦基
杀手粉红钻1967 饰演程玉珠 导演刘丹青 主演曾江、孟莉、石坚、林蛟、冯敬文
七彩封神榜1967 饰演莫绮萍 导演萧笙 主演陈宝珠、柳青、白瑛、李红、潘有声、白文彪
凤舞惊魂1967 饰演于凤 导演余河 主演冯宝宝、胡枫、麦明
我爱阿哥哥1967 饰演杨素素 导演蒋伟光 主演胡枫、薛家燕、李香琴、郑君绵、郑少秋
快乐年华1967 饰演陈美玉 导演莫康时 主演周骢、梁醒波、谭炳文、罗兰、沈殿霞
我的爱人就是你1967 饰演罗爱莲 导演珠玑 主演胡枫、欧嘉慧、杜平、范丽、乔宏
玉面女煞星1967 饰演蝙蝠女, 黄馥梅, 巴巴拉 导演王风 主演黎雯、吕奇、骆恭、沈殿霞、石坚、郑君绵
蓝色毒黄蜂1967 饰演红玫瑰 导演蒋伟光 主演胡枫、范丽、乔宏、丁慧、孙成、柔凤
蓬门淑女1967 饰演阿菊 导演陈云 主演曾江、邓光荣、高峰、梁漱华、郑君绵、王爱明
飞贼金丝猫1967 饰演金丝猫 导演蒋伟光 主演胡枫、石坚、沈芝华、陈均能、区燕青、刘家荣
青春儿女1967 饰演石兰芝 导演何建业 主演谢贤、周骢、陈齐颂、梁醒波、沈殿霞
青春之恋1967 饰演姬丽丝 导演陈云 主演胡枫、贺兰、杜平、王爱明、俞明、黎雯
闪电煞星1967 饰演方静华 导演蒋伟光 主演胡枫、石坚、郑君绵、骆恭、李寿祺
飞贼红玫瑰1967 饰演王慧芳 导演陆邦 主演胡枫、方心、麦基、上官玉、高鲁泉、矮冬瓜
双凤旗 (上集)1966 饰演江雪冰 导演凌云 主演陈宝珠、萧芳芳、石坚、李红、容玉意、杨业宏、玫瑰女
五剑群龙1966 饰演王赛凤 导演胡鹏 主演陈宝珠、张英才
碧落红尘（上集）1966 饰演水中萍 导演凌云
圣火雄风（上集）1966 饰演杜娟儿 导演萧笙 主演陈宝珠、李红、吴千枫、郑君绵、柳青、石坚
龙虎英雄传1966 饰演李小鸾 导演康毅 主演新马师曾、陈宝珠、李红、玫瑰女
秋水长天1980 饰演向依虹 导演黄以功 主演刘德凯、吴倩莲、 罗丽杉、高峰、奚红
1997年后因耳疾淡出影坛的萧芳芳专注公益事业。1998年她在美国雷吉斯大学拿到了儿童心理学硕士学位后创立了护苗基金，宣传“保护儿童免受性侵犯”的讯息。
2000年10月15日，“柴湾护苗行动及护苗队宣誓仪式”举行，“护苗基金”主席萧芳芳出席宣誓仪式，她在接受访问时表示，希望在十八区都可以举行推广护苗的行动。早前，已经完成元朗及屯门的推广行动，稍后会再到深水区，而每区都会成立护苗队。
2012年2月，“护苗基金”主席萧芳芳促请特首参选人将保护儿童的议题纳入竞选特首的政纲内，立法废除“14岁以下男童无性交能力之推定”，她亲身到三人的参选办公室递交诉求信，并送上不同的礼物。
2014年9月3日，林忆莲、张惠妹、蔡健雅及那英合办的“Project WAO”慈善音乐会，为“护苗基金”筹集善款。“护苗基金”主席萧芳芳忍着耳痛之苦亮相舞台，跪谢四位歌手以示感激。
1995 第45届柏林国际电影节最佳女主角奖 女人四十 （获奖）
2009 第28届香港电影金像奖终身成就奖 （获奖）
1997 第16届香港电影金像奖最佳女主角奖 虎度门 （提名）
1996 第15届香港电影金像奖最佳女主角奖 女人四十 （获奖）
1994 第13届香港电影金像奖最佳女主角奖 方世玉 （提名）
1994 第13届香港电影金像奖最佳女主角奖 抢钱夫妻 （提名）
1988 第7届香港电影金像奖最佳女主角奖 不是冤家不聚头 （获奖）
1996 第33届台湾电影金马奖最佳女主角奖 虎度门 （获奖）
1995 第32届台湾电影金马奖最佳女主角奖 女人四十 （获奖）
1975 第12届台湾电影金马奖最佳女配角奖 女朋友 （获奖）
2007 第1届亚洲电影大奖亚洲电影杰出贡献大奖 （获奖）
1996 第41届亚太电影节最佳女主角奖 虎度门 （获奖）
1995 第2届亚太电影节剧情长片特别奖最佳女童星 梅姑 （获奖）
1996 第1届香港电影金紫荆奖最佳女主角奖 女人四十 （获奖）
1996 第2届香港电影评论学会大奖最佳女主角奖 女人四十 （获奖）
1981 第16届台湾电视金钟奖最佳女主角奖 秋水长天 （获奖）
2010 美国CNN评选为史上最伟大二十五位亚洲演员 （获奖）
1999 香港千禧年“世纪最难忘女主角奖” 林亚珍 （获奖）
1977 第5届西班牙国际海洋电影节最佳女主角铿鱼奖 海韵 （获奖）
萧芳芳从影四十年，是一个不断以努力实现梦想的超凡女性。童星时期她一度被港台影迷誉为是中国的秀兰·邓波儿。她演唱的电影主题歌《世上只有妈妈好》日后被引入台湾电影，成为两岸三地广为流传的歌曲。（腾讯娱乐评）
在港台以至大陆的女演员当中，萧芳芳无论是才艺还是为人都有着很多值得钦佩之处。（新浪娱乐评）
萧芳芳，一个勇往直前，不断以努力实现梦想的超凡女性，她所演绎的，是一个比银幕上数百个角色都更加精彩的人生。（人民网娱乐评）
萧芳芳由于身体欠佳，淡出银幕后，积极的投身于公益事业，如1998年，她创立了护苗基金，积极宣传“保护儿童免受性侵犯”的讯息。所谓“德艺双馨”，萧芳芳当之无愧。（搜狐娱乐评）
萧芳芳除了擅长英语外，更擅长舞蹈、绘画、礼仪等。她自己曾编辑出版过英语进修教材及讲解西方礼仪的《洋相》一书，这在演员之中实在不多见。（网易娱乐评）
除了萧芳芳，大约没有其他人，能似她那样活泼轻松地对待世间的浮华烟名。（王家卫评）
萧芳芳是奇女子，可以绚烂，可以平淡，幅度之广，友人之中，以她为第一。（黄沾评）
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