安徽医科大学前身是1926年始创于上海的东南医科大学，2019年获批安徽省“三全育人”综合改革试点高校和全省党建工作示范高校，2022年入选教育部高水平公共卫生学院建设高校名单。学校是安徽省办学历史最早的高等学校之一，是安徽省第一所高等医科院校，是安徽省属重点大学，是教育部、国家卫生健康委和安徽省人民政府共建高校，是安徽省第一批地方特色高水平大学和第一批综合改革试点学校，也是安徽省医学教育中心、医学研究中心和医疗卫生服务中心。
学校现有梅山路、翡翠路、东校区和新医科中心校区，拥有研究生学院、基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院、卫生管理学院、药学院、护理学院、马克思主义学院、生命科学学院、生物医学工程学院、第一临床医学院、第二临床医学院、巢湖临床医学院、国际教育学院、人文医学学院、继续教育学院、第五临床医学院、精神卫生与心理科学学院、法学院、临床药理研究所等直属教学机构。拥有第一附属医院、第二附属医院、附属口腔医院、附属巢湖医院、附属阜阳医院等直属附属医院，另有安徽省公共卫生临床中心（安徽省传染病医院、第一附属医院北区）和多所共建附属医院、非直属附属医院、医学中心、附属疾病预防控制中心，医联体合作单位300余家，构建起覆盖全省、辐射周边、贯穿“全生命周期”的安医系健康服务体系。
学校医学及相关学科门类齐全，已形成学士、硕士、博士完整的教育培养体系。设有覆盖医学、理学、管理学、工学、法学、教育学等学科门类的数十个专业，其中有基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学博士学位授权一级学科，马克思主义理论、心理学、生物学、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、中药学、特种医学、护理学、公共管理等硕士学位授权一级学科，临床医学、公共卫生博士专业学位授权类别，临床医学、口腔医学、公共卫生、药学、中药学、护理、医学技术、电子信息、应用心理、法律等硕士专业学位授权类别。建有药学、临床医学、公共卫生与预防医学、基础医学博士后科研流动站。药学、公共卫生与预防医学、临床医学、生物学、基础医学等学科获批安徽省高等学校高峰学科。护理学、生物医学工程、心理与脑科学获批安徽省高峰培育学科立项建设。临床医学、药理学与毒理学、分子生物学与遗传学、生物与生物化学、免疫学、神经科学与行为学、环境科学与生态学、社会科学总论、精神病学与心理学、材料科学、化学、微生物学等学科进入ESI全球排名前1%。
学校是全国科普教育基地、全国首批学校急救教育省域培训基地和全国高校综合性教育实践体验基地。学校先后通过教育部本科教育水平评估和审核性评估，口腔医学、临床医学、临床药学、护理学、药学等专业通过教育部专业认证，获得多项国家级教学成果二等奖、全国教材建设奖。
安徽医科大学的前身是1926年5月由郭琦元、汤蠡舟等在原亚东医大的校址上（上海市沪军营）创办的私立东南医科大学。
1927年秋，校董会修订章程，改办大学五年制，专科即停止招生。
1928年春，杭州广济、苏州医大和广州中法3所医学院先后改组或停办，大批失学学生流入东南医大。
1930年春，学校改称东南医学院，并于1931年奉国民政府教育部训令核准立案。
1931年春，时值上海南洋医学院停办，转学来校者二百余，统计学生数达五百以上。院本部迁至上海真如镇，原校址改作附属医院。
1937年淞沪会战爆发，日军入侵，校舍尽毁，师生员工挤往在沦陷后的租界——上海萨坡赛路299号院内。
上海东南医学院院长郭琦元因担任中国红十字会救护总署负责人随军南下，学校濒于解体。在此关键时刻，众推眼科专家张锡祺教授出任院长，聘请病理学专家叶曙任教务长，他们依靠部分教授及上海、青岛等地校友，筹集资金，重建校舍，张锡祺还以自办的上海光华眼科医院营业收入贴补办学经费，使学校在条件十分艰难的情况下，得以续办。抗日战争胜利后，学校迁至上海南市制造局路。
1949年上海解放后，东南医学院响应中共中央华东局发出的“面向农村、面向内地”的号召，在汤蠡舟院长的率领下，于当年12月底整体内迁安徽怀远县西门岗，以原美国教会办的淮西中学、培德女子学校、民望医院、民康医院及省立中学等处房舍为校址，占地300多亩，成为安徽省第一所高等医科院校。
1951年6月22日，华东军政委员会卫生部批准将学校由私立改为国立，委托皖北行署正式接管，学校直属中央卫生部领导。8月27日，东南医学院附属医院从皖北怀远迁至合肥市前大街（现长江路）。
1952年，学校全部迁建合肥。当年10月，经安徽人民政府批准，东南医学院改名为安徽医学院。
1956年，经卫生部、教育部批准，学校开始招收研究生。
1968年，由于“文革”的影响，学校迁到凤台县农村，停止招生4年，第一附院停办，第二附院被部队占用，附院皖西分院也被国防工办接管，大批教职医护员工下放，人员流散，校舍、设备损失严重。
1970年春，学校迁回合肥。经省革命委员会决定，蚌埠医学院、安徽中医学院、芜湖医专撤并到安徽医学院，称“安徽医学院总校”，下设蚌埠、芜湖两分校，开始招收工农兵学员，学制三年。
1973年，省委、省革命委员会决定取消“安徽医学院总校”建制，恢复蚌埠医学院，筹建皖南医学院。
1975年，学校新建卫生系，设卫生专业；同年，部队归还第二附院。
1976年，省委、省革命委员会决定恢复安徽中医学院，中医、药学两个系连同第二附院划给中医学院，安医只保留医疗、卫生两个系，1所附院。
1978年，安徽医学院被定为省属重点大学。
1985年12月，根据安徽省医学教育事业的布局，省委省政府批准安徽医学院改名为安徽医科大学。
1990年，经国务院学位委员会批准为博士学位授权单位，成为第一个具有博士学位授予权的省属高校。
1996年6月，经国家教委批准，更名为安徽医科大学。
1998年，经教育部批准，可以招生港澳台研究生。
2003年10月，成立研究生学院（前身是1997年3月成立的研究生部）。
2010年，入选国家“特色重点学科项目”建设高校。
2011年底，入选国家建设高水平大学公派研究生项目。
2012年，入选国家“中西部高校基础能力建设工程”（一期）。同年11月，入选教育部卫生部第一批“卓越医生教育培养计划”试点高校。
2013年1月，入选国家级大学生创新创业训练计划实施高校。5月，入选第一批临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校。
2014年，入选安徽省第一批地方特色高水平大学。
2017年1月，经省编办批准，安徽省转化医学研究院正式落户学校。
2019年，获批安徽省“三全育人”综合改革试点高校和全省党建工作示范高校。
2021年，安徽医科大学（黄梅戏）入选2022—2024年度安徽省非物质文化遗产传承基地名单。同年10月，与安徽省药品监督管理局签约合作共建“安徽省药品监管科学研究中心”。
2022年，入选教育部高水平公共卫生学院建设高校名单。同年3月，成为“一带一路”热带医学联盟常务理事单位。同年4月，安徽医科大学新医科中心（新校区）项目获批向社会公布。
2024年1月，安徽医科大学附属马鞍山市疾病预防控制中心揭牌。3月，安徽医科大学附属六安市疾病预防控制中心揭牌 。10月，安徽医科大学新医科中心（新校区）顺利启用。
以上信息源自官网，数据截止至2025年6月，请以官网为准！
