2000年2月1日，国立嘉义技术学院及国立嘉义师范学院整合成立嘉义大学，现拥有兰潭校总区、民雄校区、民生校区、林森校区及中埔乡社口实习林场，另有附设实验国民小学及附属幼儿园，占地面积合计283公顷。
早在1919年4月，台湾公立嘉义农林学校创校，旨在培养台湾农业及林业人才，第一任校长藤黑总左卫门，创校校址在山仔顶（嘉义市东区中山路7号，今嘉义高商）。1938年迁至今民生校区(嘉义市西区新民路580号)，1985年行政中心迁至兰潭校总区(嘉义市东区学府路300号)。
1931年嘉义棒球队(KANO)首次获得台湾地区甲子园大赛代表权，在教练近藤兵太郎的带领下到日本甲子园参加第十七回全国中等学校优胜野球大会，那一回甲子园大赛总共有二十三队参赛，嘉义棒球队一路过关斩将，在决赛中以零比四输给中京商业，勇夺亚军，震惊日本全国。
国立嘉义大学六个学院涵盖人文、艺术、教育、农业、理工、管理、生命科学等学术领域，实源于前身嘉师、嘉技两校长期的系科扩充与发展，大部分系所都可以在两校科系的发展中找到源头。嘉师在师专时期，五十五年设国校师资格，六十六学年度改称普通科，七十二年增设二年制幼儿教育师资科。升格改制为师院后，初设初等教育、语文教育、社会科教育、自然科教育四系及附设二年制幼教科，八十一年增设幼儿教育系、特殊教育系，八十二年增设音乐教育系，八十六年增设美劳教育系。研究所方面，八十三年首设初等教育研究所（其后改名为国民教育研究所）硕士班，八十七年增设家庭教育研究所硕士班。嘉技在五十四年升格为农专时设农艺、园艺、森林、农产加工、畜牧兽医与农业工程等六科，其后陆续增设，至八十二学年度，五年制已发展为十二科：农艺、园艺、森林资源管理、林产工业、畜牧、兽医、食品工业、农业机械工程、农业土木工程、农业经济、植物保护、水产养殖。八十八学年度共设有农艺系（科）、园艺系（科）、森林系（科）、木材科学系（科）、畜牧系（科）、兽医系、食品科学系（科）、农业机械工程系（科）、农业土木工程系（科）、农业经营系（科）、植物保护系（科）、水产养殖系（科）、农业经济科、农场管理科等十四系（科）及共同学科。长期的系科发展，嘉师在教育、人文、艺术、数理领域，嘉技在农学、理工、生命科学等领域，已枝叶渐茂，奠定基础，嘉大整而合之，学术发皇，诚可期也。
八十九学年度合并大学后，设有人文艺术学院、教育学院、管理学院、农学院、理工学院、生命科学院等六个学院，其下成立28个学系与14个研究所。教育学院有5系5所：教育学系、幼儿教育学系、特殊教育学系、辅导学系、体育学系；国民教育研究所（硕士班、博士班）、家庭教育研究所（硕士班）、特殊教育研究所（硕士班）、幼儿教育研究所（硕士班）、教育科技研究所（硕士班）；人文艺术学院有5系1所：中国文学系、外国语言学系、史地学系、音乐学系、美术学系、视觉艺术研究所（硕士班）；管理学院有3系1所：企业管理学系、应用经济学系、生物事业管理学系、管理研究所（硕士班）；农学院有6系2所：农艺学系、园艺学系、森林学系、林产科学系、畜产学系、兽医学系、农学研究所（硕士班）、林业研究所（硕士班）；理工学院有5系3所：应用化学系、应用物理学系、应用数学系、生物机电工程学系、土木与水资源工程学系、数学教育研究所（硕士班）、科学教育研究所（硕士班）、资讯工程研究所（硕士班）；生命科学院有4系2所：食品科学系、水产生物学系、生物资源学系、分子与生物化学系、食品科学研究所（硕士班）、生物科技研究所（硕士班）。
另国立嘉义大学进修推广部，提供嘉云南地区在职人员进修，充分利用教育资源，服务及回馈小区。在这方面，该校前身嘉师及嘉技已有丰硕成果，嘉大踵事其后，扩充规模。原嘉义农专二年制夜间部六十年初设食品加工及兽医两科，后逐年增置，后来也发展到农艺、园艺、森林资源管理、林产工业、兽医、食品工业、农业机械工程、农业土木工程、农业经济、农业经营、植物保护、水产养殖等十二科。八十六年嘉农升格为嘉义技术学院，夜间部更名为进修部。而原嘉师在五十九年成立暑期部时设二年制国校师资科，六十一年附设普通师范科，六十二年设二年制国校师资科利用空中教学，六十七年附设幼儿园教师进修班，六十八年增设二年制幼儿教育师资科，七十一年代办托儿所教保人员进修班。此外，夜间部六十年设二年制国校师资科，六十九年增设二年制幼儿教育师资科，并附设幼儿园教师进修班，七十二年代办托儿所教保人员进修班。嘉义师院进修部则开设有国民教育研究所在职学分班、学士学位班、幼教系学士学位班、初教系学士学位班、国小师资教育学分班、特殊教育师资教育学分班等班次。原嘉师及嘉技的进修推广教育，培育无数国小、幼儿园教师及教育行政人员，也培养无数农、林、渔业人才。嘉大在此基础上，百尺竿头，继续努力。
顺应国家需要与学术潮流，承续嘉义师范学院及嘉义技术学院的特色与学术资源，国立嘉义大学的发展兼重人文与科技，并拥有良好的师资，坚强的师资阵容与蓬勃的研究风气，是该校的重要特色。至九十五学年师范学院〔注2〕计有6系10所：教育学系、辅导与咨商学系〔注3〕、体育学系、特殊教育学系、幼儿教育学系、数字学习设计与管理学系、国民教育研究所（硕士班、博士班）、特殊教育研究所（硕士班）、辅导与咨商研究所（硕士班）、体育与健康休闲研究所（硕士班）、幼儿教育研究所（硕士班）、教育科技研究所（硕士班）、家庭教育研究所（硕士班）、教育行政与政策发展研究所（硕士班）、数学教育研究所（硕士班）、科学教育研究所（硕士班）；人文艺术学院有5系5所：中国文学系、美术学系、史地学系、外国语言学系、音乐学系、中文研究所（硕士班）、视觉艺术研究所（硕士班）、史地研究所（硕士班）、外国语言研究所（硕士班）、音乐与表演艺术研究所（硕士班）；管理学院有4系6所：企业管理学系、应用经济学系、生物事业管理学系、信息管理学系、管理研究所（硕士班、博士班）、营销与流通管理研究所（硕士班）、应用经济研究所（硕士班）、生物事业管理研究所（硕士班）、信息管理研究所（硕士班）、休闲事业管理研究所（硕士班）；农学院有8系8所：农艺学系、园艺学系、森林暨自然资源学系〔注4〕、林产科学系、动物科学系〔注5〕、兽医学系、生物农业科技学系、景观学系、农艺研究所（硕士班）、园艺研究所（硕士班）、森林暨自然资源研究所（硕士班）、林产科学研究所（硕士班）、动物科学研究所（硕士班）、兽医研究所（硕士班）、农学研究所（博士班）、农业生物技术研究所（硕士班）；理工学院有6系7所：应用物理学系、应用化学系、应用数学系、资讯工程学系、生物机电工程学系、土木与水资源工程学系、光电暨固态电子研究所（硕士班）、应用化学研究所（硕士班）、应用数学研究所（硕士班）、资讯工程研究所（硕士班）、生物机电工程研究所（硕士班）、土木与水资源研究所（硕士班）、运输与物流工程研究所（硕士班）；生命科学院有5系6所：食品科学系、水生生物科学系〔注6〕、生物资源学系、分子与生物化学系、微生物与免疫学系、食品科学研究所（硕士班）、水生生物科学研究所（硕士班）、生物资源研究所（硕士班）、生物科技研究所（硕士班）、微生物与免疫研究所（研究所）、生物药学研究所（硕士班）。
嘉义大学现有专任教师489名；九十五学年度学生人数为研究所2477人，大学部8980人，合计11457人。嘉技及嘉师历届毕业校友达6万余人，遍布海内外，从事公、教、农、工、商或民意代表，均能各用所学，各展长才，贡献社会，卓然有成。
国立嘉义大学源远流长，发展与成长的过程，与80年来台湾经济、社会、教育的需要与变迁，息息相关，脉脉相连。2000年2月1日由国立嘉义师范学院及国立嘉义技术学院两校整合而成。国立嘉义大学的诞生，满足了地方人士期盼一所大学的宿愿，也是台湾近几十年来大学校院整合成功的首例与典范。
原国立嘉义师范学院前身创立于1957年，校名为“台湾省立嘉义师范学校”，校址在今林森校区（林森国小旧址）。嘉师的成立，旨在培育优秀的小学师资，满足当时小学师资的需求及嘉云地区小学教学辅导的需要。
1966年8月改制为“台湾省立嘉义师范专科学校”，为五年制专校，招收初（国）中毕业生，1983年因应我国学前教育发展的需要，增设二年制幼儿教育师资科，培养幼儿园教师。在职进修教育方面，1970年成立暑期部，1971年成立夜间部。在1987年开始辟建民雄校区，同年七月升格改制为“台湾省立嘉义师范学院”，招收大学部学生，并成立进修部，供在职小学、幼儿园教师及教育行政人员进修。1991年改隶中央，定名为“国立嘉义师范学院”，1992年民雄校区启用，行政中心及大部分学系迁此。在大学部奠定良好基础后，1994年开始发展研究所，数年后并着手筹设博士班。四十三年历史，嘉师培育出无数优秀的国小、幼儿园、托儿所师资及学校行政、教育行政、国民教育研究人才。同时，长期负责嘉云地区国小及幼儿园教学辅导工作，对辅导区初等教育及学前教育的改进与发展，贡献良多。优秀师资的培育，浓郁的人文、艺术气息，成为嘉师的特色。
原国立嘉义技术学院前身创立于民国八年，校名为“台湾公立嘉义农林学校”，旨在培养台湾农业及林业人才。1921年4月易名为“台南州立嘉义农林学校”，1945年11月易名为“台湾省立嘉义农业职业学校”，1951年7月易名为“台湾省立嘉义高级农业职业学校”，1965年3月升格改制为“台湾省立嘉义农业专科学校”，为五年制专校。1971年设立二年制夜间部，1975年增设二年制日间部。1981年7月改隶中央，易校名为“国立嘉义农业专科学校”，1997年7月升格改制为“国立嘉义技术学院”。其间，伴随学校发展，校址数易，创校校址在山仔顶（即国立嘉义高商现址），1938年迁至今新民校区，1985年行政中心迁至兰潭校区现址。八十一年悠久历史，结合了自然、科学和产业的领域，和美国、日本、韩国、菲律宾等国家进行学术及技术交流，成为国家培育农业科技精英人才的摇篮。当年嘉农棒球队更曾扬威甲子园，风靡东瀛，开启台湾棒球运动风气，国人至今犹津津乐道。
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