黑龙江农业工程职业学院始建于1948年，是国内创建最早的专门培养粮食生产、农业机械化和畜牧水产养殖人才的职业院校。学校是国家示范性高职院校、国家优质专科高职院校、国家“双高计划”建设单位、全国乡村振兴人才培养优质校、全国教学诊断与改进工作试点院校、国家级现代学徒制试点院校、全国职业院校数字校园实验校。2022年，学校被列入省“十四五”高校设置规划重点建设农业职业技术大学。学校获黑龙江省五一劳动奖状，入选国家级高技能人才培训基地A档建设单位。
学校现有南岗校区、松北校区和海伦、齐齐哈尔、北安、哈尔滨道里区榆树基地及农业装备技术示范园，学校坚持“以农为本，以工为基，农工融合，强工兴农”的专业发展定位，构建以农业装备技术为特色，农牧渔类协同发展，生物技术、信息技术、智能技术、水利工程技术和农业经济管理为支撑的专业（群）格局，拥有多个省级高水平专业群、国家级高水平专业群、国家级重点专业。
学校先后被授予全国职业教育先进单位、全国就业典型经验高校、中国职业教育百强院校、全国农业系统先进集体、全国科教兴农先进学校、全国青少年农业科普基地、全国总工会职工书屋、全国高校后勤十年社会化改革先进院校等荣誉称号，连续多届荣获省级文明单位（校园）标兵荣誉称号，获批省级工匠学院、全省高职高专院校特色马院、全省高校心理健康教育“示范中心”、省数字技术工程师培育基地、哈尔滨市科普基地。
学校前身
原黑龙江农业工程职业学院
1949年11月，东北机械农场技术训练班创建。
1950年10月，东北机械农场技术训练班更名为东北公营机械农场干部训练班。
1951年10月，东北公营机械农场干部训练班更名为东北公营农场技术学校。
1952年4月，东北公营农场技术学校更名为东北国营农场技术学校。
1953年1月，东北国营农场技术学校更名为哈尔滨农业机械化学校。11月，查哈阳机耕学校并入，改建为东北农学院附设农业机械化学校。
1956年7月，东北农学院附设农业机械化学校改建为黑龙江哈尔滨农业机械化学校，佳木斯农业机械化学校（农机专业）并入。
1958年8月，东北农学院农业机械化分院（含中专部）创建。
黑龙江农业机械化学院
1959年7月，东北农学院农业机械化分院改建为黑龙江农业机械化学院。11月，齐齐哈尔大学、东北农学院合江分院部分师生并入。
1963年8月，黑龙江农业机械化学院更名为黑龙江农业机械化学校。
1969年9月，黑龙江农业机械化学校停办。
1972年11月，黑龙江农业机械化学校筹备复校。
1974年5月，黑龙江农业机械化学校复校黑龙江省农业机械化学校。
2001年3月，黑龙江农业机械化学校升格为黑龙江农业工程职业学院。
2003年，学院被农业部确定为首批“能力建设试点院校”和“农村富余劳动力转移培训基地”。
2004年，学院被教育部等有关部门确定为数控技术专业领域和汽车运用与维修专业领域两个技能型紧缺人才培养培训基地。
2005年，学院被教育部等七部委评为全国职业教育先进单位。
2007年，学院被教育部、财政部确定为“国家示范性高等职业院校建设计划”建设单位。。
2010年，学院通过国家示范性高等职业院校验收。
2013年，学院被授予 全国毕业生就业典型经验高校‛荣誉称号。
2017年3月，学院获批建设“工业机器人应用人才培养中心”。
2019年7月，被教育部认定为国家优质专科高等职业院校。2019年12月，被教育部、财政部列入第三类高水平专业群建设单位（B档）。
2021年6月，黑龙江农业工程职业学院海伦乡村振兴学院挂牌。
黑龙江生物科技职业学院
1.黑龙江省北安农业学校
1948年7月，黑龙江农业干部学校成立，校址克山西门外。
1949年，迁到北安北岗。
1956年，改建为北安农学院，4月30日全院师生隆重召开农专改学院大会，热烈庆祝北安农学院的诞生。设有土化和农学两个系。
1958年4月，学校划分出一部分师资力量迁移长春与当地几所学校组建吉林农业大学。之后学校还叫过东北农学院嫩江分院。
1956年，学校又有部分资源迁移齐齐哈尔组建齐齐哈尔农业学校（今黑龙江畜牧兽医职业学院）。
1964年，学校资源再次从新划分出一部分师资力量组建了牡丹江师范学院。
2.黑龙江省水产学校
1959年8月，黑龙江省商学院水产中专班创建。校址在哈尔滨市道外区，由省水产局主管。
3.黑龙江省齐齐哈尔农业机械化学校
1972年，齐齐哈尔农业机械化学校始建，隶属于黑龙江省农业委员会。学校位于北方名城齐齐哈尔市富拉尔基区。
2000年2月，经省教育厅批准为省部级重点中等专业学校。
4.黑龙江农牧水产职业学院
2003年初，黑龙江省北安农业学校与黑龙江省水产学校组建黑龙江农牧水产职业学院。
5.黑龙江生物科技职业学院
2004年4月，更名为黑龙江生物科技职业学院。
2008年，学院在教育部高职高专人才培养工作水平评估中获得优秀。
2011年，学院成为黑龙江省首批骨干高等职业院校建设单位。
2016年8月，入选第二批国家现代学徒制试点单位。
2019年10月，通过教育部现代学徒制第二批试点单位验收。黑龙江省齐齐哈尔农业机械化学校并入学院。
合并组建
2022年4月，黑龙江农业工程职业学院与黑龙江生物科技职业学院合并，组建新的黑龙江农业工程职业学院。同年，学校被列入省“十四五”高校设置规划重点建设农业职业技术大学。
2025年5月，学校入选2025年高素质农民省级示范项目承担机构。
以上信息源自官网，数据截止至2025年6月，请以官网为准！
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