南通师范高等专科学校由南通校区、如皋校区、开发区校区组成。南通校区位于濠河风景区（国家5A级）内，钟灵毓秀，人文荟萃。如皋校区“师范学堂旧址”古建筑群系全国第七批重点文物保护单位。开发区校区四面环水，书院风格，融合了中国元素、南通元素、师范元素和生态元素，是南通的文化地标之一。全校占地面积574亩，建筑面积27万平米，教学科研设备总值0.71亿元，馆藏图书83万册。
截至2019年4月，学校有全日制在校生10000余人，设有学前教育第一学院、学前教育第二学院、初等教育学院、管理学院、信息技术学院、音乐舞蹈学院、体育学院、美术学院、马克思主义学院、民族教育学院等10个二级学院，开设学前教育、小学教育、语文教育、数学教育、英语教育、音乐教育、美术教育、体育教育等8个师范专业，以及商务英语、计算机应用技术、艺术设计、财务管理、文秘等20个非师范专业；从2014年开始先后与南通大学、江苏第二师范学院、南京晓庄学院通过“3+2”及“5+2”模式合作培养本科层次小学、幼儿园教师。
南通师范高等专科学校的前身是中国著名实业家张謇于1902年创办的民立通州师范学校，是中国师范教育的三大源头之一，也是中国第一所独立设置的师范学校；1953年转为公立，改名江苏省南通师范学校；1958年与创办于1905年的南通女子师范学校合并。
2005年5月，经江苏省教育厅批准，由江苏省南通师范学校和江苏省海门师范学校合并组建南通高等师范学校，同时增挂江苏教育学院南通分院的牌子。
2014年1月12日，经江苏省人民政府同意南通高等师范学校升格为南通师范高等专科学校。
2015年2月3日，经南通市人民政府同意南通师范高等专科学校与如皋高等师范学校合并办学。
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