南方医科大学前身为中国人民解放军第一军医大学，创建于1951年，1979年被确定为全国重点大学，2004年8月整体移交广东省，更名为南方医科大学，现有广州校区和顺德校区。学校是广东省首批5所省属高水平大学重点建设高校中唯一的医学院校，全国首批“部委省”共建医科高校，全国首批开设八年制临床医学专业（本博连读）的8所高校之一，全国首批卓越医生、卓越医生（中医）教育培养计划试点高校。2024年入围泰晤士高等教育世界大学排行榜300强。
学校是唯一开设八年制医学教育的独立医科院校，“基础医学拔尖学生培养基地”入选国家基础学科拔尖学生培养计划2.0基地，成为教育部“101计划”高校，基础医学、临床医学入选“101计划”。现有多个国家特色专业、广东省特色专业、广东省名牌专业，拥有多个国家重点及培育学科、国家中医药管理局重点学科、广东省重点学科、广州市重点学科；多个学科入围ESI全球前1%，其中临床医学和药理学与毒理学入围全球前0.5‰，已形成了以医学为主，理学、工学、法学、管理学、教育学等多学科协调发展的学科体系。
学校现有国家重点实验室、国家临床医学研究中心、粤港澳大湾区脑与类脑研究中心等国家和省部级科研平台百余个，学校先后在Nature、Cell、NEJM、JAMA、Lancet等国际著名期刊发表高水平论文，其《南方医科大学学报》多次荣获“百种中国杰出学术期刊”称号，综合评价得分位列全国医科大学学报类期刊前列。
学校现有多家直属附属医院、合作共建医院，其中南方医院、附属广东省人民医院、珠江医院、第十附属医院（东莞市人民医院）进入广东省高水平医院建设行列，多所附属医院获国家公立医院绩效考核A以上等级。南方医院牵头建设国家创伤区域医疗中心、国家区域中医（风湿病科）诊疗中心，入选国家紧急医学救援基地、国家疑难病症诊治能力提升工程。附属广东省人民医院牵头建设国家心血管区域医疗中心。南方医院入选国家中西医协同“旗舰”医院试点项目建设单位，珠江医院、中西医结合医院入选广东省中西医协同“旗舰”医院建设项目。
1951年6月，原东北军区根据第二届全军卫生教育会议的决定，经军委批准，决定以第二陆军医院为基础，在齐齐哈尔市建东北军区军医学校。
1953年1月，更名中国人民解放军第十一军医中学。
1954年5月，根据全军《军医中学整编方案》，学校改称中国人民解放军第十一军医学校。
1956年1月18日，学校由原属东北军区领导转由总后勤部领导。
1958年7月，学校集体转业，移交黑龙江省人民政府领导，第十一军医学校与第2164医院合并，改名为“齐齐哈尔医学院”。
1962年1月，学校重归军队，隶属总后勤部，校名为“中国人民解放军齐齐哈尔医学院”。
1966年10月，校名改为“中国人民解放军军医学院”。
1969年9月，学校迁至湖南省长沙市。
1970年，广州军区卫生学校并入；2月，学校再迁至广州市当时已停办的暨南大学校址，由广州军区代管。
1975年7月，中央军委决定将原由广州军区代管的军医学院改由总后勤部领导，“为统一番号序列，原中国人民解放军军医学院改为中国人民解放军第一军医大学，并隶属总后勤部建制”。
1978年，原暨南大学恢复办学；4月，中央军委批准第一军医大学新址定于广州市东北郊麒麟岗。
1979年，被确定为全国重点大学。
1980年，广州军区军医学校再次并入。
1993年，第一军医大学（护理系，原广州军区军医学校部分）分出，改建中国人民解放军广州医学高等专科学校。
1999年，中国人民解放军广州医学高等专科学校第三次并入。
2004年，被批准为全国首批8所试办八年制医学教育的高等院校之一；8月，按照国务院、中央军委下达的命令，整体移交广东省，更名为南方医科大学。
2010年，入选国家“特色重点学科项目建设”高校。
2011年底，入选国家建设高水平大学公派研究生项目。
2012年11月，入选第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校。
2016年2月6日，成为省部部共建高校；4月，入选广东省高水平大学重点建设高校。
2017年，经省编委正式批准，广东省口腔医院、广东省皮肤病医院、广东省深圳牙科医疗中心正式更名为南方医科大学口腔医院、南方医科大学皮肤病医院、南方医科大学深圳口腔医院，并成为南方医科大学直属附属医院。
2018年8月，学校入选国家“111计划”；11月，入选广东省新一轮高水平大学建设计划中的“高水平大学重点建设高校”；同月，南方医科大学成立中国国内首家护理与助产循证中心。
2020年10月16日，入选国家知识产权局、教育部“2020年度国家知识产权试点高校名单”。
2021年2月，学校“基础医学拔尖学生培养基地”入选国家基础学科拔尖学生培养计划2.0基地。
2023年2月，入选“第七批中国20世纪建筑遗产”推介项目名录。
2024年8月24日，南方医科大学空天医学工程研究中心正式揭牌成立
2025年3月5日，南方医科大学深圳眼科医学中心揭牌。
以上信息源自官网，数据截止至2025年6月，请以官网为准！
